По нашему договору вы не должны перекладывать комиссию на пользователя.
То есть если клиент оплачивает 1000 рублей то и чек надо сформировать на эту сумму.
В соответствии с
правилами 6.2.3. Поставщик не вправе взимать с Плательщиков вознаграждение или возлагать на них какие-либо дополнительные расходы в связи с осуществлением ими переводов через Оператора, если иное не будет согласовано с Оператором.