Все зависит от того, относится ли ваша организация к типам бизнеса, которым разрешено работать без ККТ (ст. 2 ФЗ № 54-ФЗ, ознакомиться с текстом закона можно
по ссылке. Также освобождение получили ИП на патенте, кроме указанных в некоторых подпунктах п. 2 ст. 346.43 НК РФ.
Данный вопрос корректней адресовать в региональную инфспекцию ФНС. Если вы являетесь предприятием, которому разрешено работь без ККТ, то регистрация ККТ не нужна, если же наоборот, то регистрация ККТ необходима. В первом случае вы можете подключить ЮKassa без онлайн-кассы.