Если подключить ЮKassa как самозанятый, есть ли какие-то ограничения по API и/или по функционалу приема платежей?

API протокол для всех одинаков. Для самозанятых существует законодательный лимит по приёму платежей — не более 2,4 млн. рублей в год. В ЮKassa также есть лимит по приёму платежей с банковских карт — до 100 тыс. рублей в месяц. Однако, если вы исчерпаете этот лимит, просто напишите менеджеру, чтобы его увеличить. По умолчанию вам будут доступны оплаты банковскими картами, выпущенными банками РФ (для юридических лиц и ИП по умолчанию сразу доступны карты РФ и СНГ). По умолчанию для самозанятых будут сразу подключены 5 методов оплаты: банковские карты, ЮMoney, оплата наличными через терминалы, WebMoney и инвойсинг Тинькофф.